5月28日,四川农业大学、中科院遗传与发育研究所、河北大学等单位合作在《Cell》杂志发表题为“Pan-genome analysis based on 33 high-quality assemblies provides insights into hidden genomic variations in rice”的研究论文。我校杜会龙教授为论文共同第一作者。
在作物进化和驯化过程中,基因组结构变异(SVs)和基因拷贝数变异(gCNVs)是重要的遗传变异来源,到目前为止,还未有对SV和gCNV全面准确的鉴定报道。
研究人员选取了遗传背景具有高度代表性的33个水稻材料,并对其中31份材料进行了长片段PacBio测序、高质量基因组组装及基因注释。同时,研究人员对33个高质量的水稻基因组进行了系统的基因组比较分析,鉴定到了大量先前尚未发现的SVs和gCNVs,探究了SV在亚洲栽培稻群体中的分布规律和形成机制,揭示了大量SVs和 gCNVs与基因表达量变化显著相关,发现了多个与重要农艺性状相关的复杂优异等位变异,证实了SV和gCNV对调控水稻农艺性状的重要作用。
杜会龙毕业于中科院遗传与发育研究所,为我校高层次引进人才。目前课题组主要开展的研究方向是基于各类测序数据的基因组组装软件开发等多方面的高端研究工作。
(生命科学院、科学技术处 供稿)
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